In un comunicato, il ministero del Tesoro Usa ha precisato che dal 2006 "Iran Air ha trasportato materiale militare per i Guardiani della Rivoluzione islamica", il braccio politico dell'esercito iraniano. Il Tesoro Usa denuncia che "missili sono stati imbarcati su voli passeggeri di Iran Air, e ufficiali dei Guardiani prendono occasionalmente il controllo dei voli di Iran Air che trasportano merce destinata ai Guardiani della Rivoluzione".
Iran Air conta su 35 destinazioni internazionali, in Asia e in Europa, con una quarantina di aerei. Nel luglio del 2010 l'Unione Europea ha vietato per ragioni di sicurezza il suo spazio aereo a più della metà dei voli della compagnia iraniana.